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shRNA表達(dá)克隆的這些特性,了解一下

發(fā)布日期: 2021-10-27
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   shRNA表達(dá)克隆是將針對(duì)靶基因設(shè)計(jì)shRNA(小發(fā)夾結(jié)構(gòu)RNAi)靶點(diǎn)序列,然后將其裝于表達(dá)載體中,我公司現(xiàn)可提供4套表達(dá)載體,可用于對(duì)人、小鼠、大鼠以及其他物種的全基因組范圍的基因表達(dá)抑制研究。公司還提供相應(yīng)的全長(zhǎng)人類(lèi)和小鼠基因的ORF表達(dá)克隆,可用于相應(yīng)基因的功能獲得研究,還可用于shRNA克隆的確證。
  
  shRNA表達(dá)克隆的特性
  1.所有shRNA靶點(diǎn)序列的選取均經(jīng)過(guò)準(zhǔn)確算法計(jì)算。根據(jù)基因的不同,shRNA其莖的長(zhǎng)度在19到29堿基對(duì)之間。這些保證shRNA克隆表達(dá)后有很高的表達(dá)抑制效率和zui低的脫靶效應(yīng)(offtargeteffect)。
  
  2.克隆shRNA所采用的載體有慢病毒載體和以哺乳動(dòng)物細(xì)胞為宿主的載體,各類(lèi)載體擁有不同的啟動(dòng)子和跟蹤標(biāo)記基因可供選擇。
  
  3.載體中所帶有的綠色熒光跟蹤標(biāo)記基因(eGFP)可以用于監(jiān)測(cè)質(zhì)粒載體的轉(zhuǎn)染效率和轉(zhuǎn)導(dǎo)病毒的感染效率。
  
  4.載體結(jié)構(gòu)上帶有穩(wěn)定細(xì)胞株的篩選標(biāo)記(嘌呤霉素)和綠色熒光跟蹤標(biāo)記基因(EGFP),這些特性使得該載體既能用于穩(wěn)定抑制效應(yīng)的研究,也
  5.可用于瞬時(shí)抑制效應(yīng)的研究。
  
  6.使用慢病毒載體系統(tǒng),可轉(zhuǎn)導(dǎo)shRNA進(jìn)入常規(guī)的分裂細(xì)胞,以及不分裂而難以轉(zhuǎn)染的目的細(xì)胞株。
  
  7.載體的各部分序列已經(jīng)過(guò)測(cè)序,包括啟動(dòng)子、編碼shRNA的正義和反義鏈、發(fā)夾結(jié)構(gòu)、終止子和其他接頭序列。
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